Phát biểu tại buổi làm việc, Chủ tịch Nguyễn Minh Triết đã đánh giá cao những thành tích mà ĐHQGHN đạt được trong các lĩnh vực hoạt động, đặc biệt là những nỗ lực không ngừng của ĐHQGHN trong việc thực hiện sứ mệnh và nhiệm vụ được Nhà nước và Chính phủ tin tưởng giao phó. Chủ tịch nước Nguyễn Minh Triết nhấn mạnh: “Sau 14 năm chính thức hoạt động theo quy chế đặc biệt do Thủ tướng Chính phủ ban hành, với quyền tự chủ - tự chịu trách nhiệm cao trong hệ thống giáo dục đại học của đất nước, những thành tích của ĐHQGHN đã và đang khẳng định sự đúng đắn và sáng suốt trong chủ trương của Đảng và Nhà nước - quyết tâm xây dựng một đại học chất lượng cao, ngang tầm các đại học tiên tiến trong khu vực, từng bước tiếp cận trình độ quốc tế, giữ vai trò nòng cốt trong công cuộc đổi mới nền giáo dục đại học nước nhà”.

Bên cạnh những kết quả về nâng cao chất lượng đào tạo, ĐHQGHN còn được ghi nhận là đơn vị đầu tiên đưa ra sáng kiến và thực hiện đào tạo hệ cử nhân khoa học tài năng với chất lượng được đánh giá cao ở Việt Nam và nhiều cơ sở đào tạo có uy tín trên thế giới. Mô hình đào tạo này hiện đang được nhiều trường đại học lớn của Việt Nam học tập và nhân rộng.

Về phương hướng phát triển của ĐHQGHN trong thời gian tới, Chủ tịch nước Nguyễn Minh Triết cho rằng: Đại học Quốc gia là một mô hình hay và đã hoạt động hiệu quả trong thời gian qua. Chủ tịch nước đề nghị ĐHQGHN cần tiếp tục nâng cao và hoàn thiện mô hình tự chủ - tự chịu trách nhiệm, điều chỉnh những gì còn bất hợp lý. Phải có tự chủ mạnh thì yếu tố tự chịu trách nhiệm mới được nâng cao... ĐHQGHN cần phải từng bước ngang tầm khu vực và ngang tầm quốc tế. Với vai trò của một “máy cái”, ĐHQGHN cũng cần chú trọng tới lĩnh vực đào tạo sau đại học, để từ đó đào tạo được nhiều tiến sĩ, nhiều nhà khoa học nhằm tăng cường cho các cơ quan khác. Công tác bồi dưỡng, phát triển đội ngũ cán bộ phải được quan tâm hơn nữa, phải mạnh dạn đưa cán bộ đi nghiên cứu, đào tạo ở nước ngoài để có thể nhanh chóng tiếp cận với những tiến bộ nghiên cứu khoa học của thế giới.

Chủ tịch nước Nguyễn Minh Triết cũng đề nghị các bộ, ngành hữu quan ủng hộ tối đa những kiến nghị của ĐHQGHN nhằm xây dựng và phát triển ĐHQGHN trở thành đại học đa ngành, đa lĩnh vực, định hướng nghiên cứu đạt trình độ quốc tế. Chủ tịch nước nói: "Kinh phí đào tạo của nước ta còn khá khiêm tốn so với nước khác, bởi vậy nếu không có quyết sách mạnh mẽ thì khó có thể sánh kịp với các nước trong khu vực và trên thế giới. Tuy nhiên, những quyết sách phải gắn với chương trình cụ thể, phải ưu tiên trọng tâm, trọng điểm. ĐHQG ở Hà Nội và TP. Hồ Chí Minh là hai trung tâm giáo dục, đào tạo của đất nước, việc ưu tiên cho những trung tâm này là điều rất cần thiết".

Chủ tịch nước Nguyễn Minh Triết hoan nghênh và ủng hộ 5 đề nghị mà GS.VS Đào Trọng Thi - Giám đốc ĐHQGHN đã nêu. Chủ tịch nước chúc ĐHQGHN, trên cơ sở những thành tích đã đạt được, sẽ có những bước phát triển nhảy vọt, tiến nhanh, tiến dài và vững chắc hơn nữa trên chặng đường tiếp theo.