Đợt 2 kỳ thi tuyển sinh đại học năm 2008 tại ĐHQGHN được tổ chức ở 3 hội đồng tuyển sinh: Trường ĐHKHTN (Khối B) với 4.470 thí sinh đăng ký dự thi (ĐKDT), Trường ĐHKHXH&NV (Khối C) với 8.427 thí sinh ĐKDT và Trường ĐH Ngoại ngữ (Khối D) với 10.341 thí sinh ĐKDT. Tổng cộng số thí sinh ĐKDT đợt 2 là 23.238. Như vậy, với số lượng 15.454 thí sinh làm thủ tục dự thi trên tổng số 23.238 thí sinh ĐKDT (Khối B, C, D) đã đạt 66,50 %.

Khối thi	Số thí sinh ĐKDT	Số thí sinh làm thủ tục dự thi	Tỉ lệ (%)
B	4.470	3.355	75,06
C	8.427	5.717	67,84
D	10.341	6.382	61,71
B-C-D	23.238	15.454	66,50

Do số lượng thí sinh thi đợt 2 đông hơn, số khối thi nhiều hơn nên số điểm thi, phòng thi, cán bộ được huy động nhiều hơn đợt 1. Nhận thấy sự khó khăn và phức tạp hơn so với đợt 1, Ban Chỉ đạo tuyển sinh đã trực tiếp kiểm tra và lưu ý với các hội đồng tuyển sinh: rà soát lại công tác chuẩn bị, có phương án dự phòng khắc phục sự cố khi mưa bão, mất điện hoặc ùn tắc giao thông (có thể xảy ra); kiểm tra kỹ ảnh của thí sinh với hồ sơ lưu; tuyệt đối bảo đảm an toàn việc in sao đề và vận chuyển đề thi đến các điểm thi...

Lịch thi đợt 2 (ngày 9-10/7/2008):

Ngày	Buổi	Khối
		B	C	D
9/7	Sáng	Sinh học	Văn	Văn
	Chiều	Toán	Lịch sử	Toán
10/7	Sáng	Hóa học	Địa lý	Ngoại ngữ
	Chiều	Dự trữ