Ngày 11/03/2016, Giám đốc ĐHQGHN đã ban hành quyết định số 986/QĐ-ĐHQGHN công nhận ông Tô Huy Rứa, phó giáo sư, tiến sĩ, nguyên Ủy viên Bộ Chính trị, Bí thư Trung ương Đảng, Trưởng Ban Tổ chức Trung ương là Hiệu trưởng danh dự Trường Đại học Việt Nhật thuộc ĐHQGHN.

Cùng ngày, tại quyết định số 988/QĐ-ĐHQGHN, Giám đốc ĐHQGHN đã bổ nhiệm ông Furuta Motoo, giáo sư, tiến sĩ, quốc tịch Nhật Bản, giữ chức Hiệu trưởng Trường ĐH Việt Nhật kể từ ngày 12/04/2016.