1.	Ban Quản lý và phát triển Dự án Phòng phát triển dự án Phòng Quản lý dự án Văn phòng
2.	Cơ quan ĐHQGHN Ban Chính trị và Công tác Học sinh – Sinh viên Ban Đào tạo Ban Kế hoạch – Tài chính Ban Khoa học – Công nghệ Ban Quan hệ Quốc tế Ban Thanh tra Ban Xây dựng Văn phòng Văn phòng Công đoàn Văn phòng Cựu giáo chức Văn phòng Đoàn thanh niên, Hội sinh viên
3.	Khoa Luật Bộ môn Hành chính - Hiến pháp Bộ môn Luật Dân sự Bộ môn Luật Kinh doanh            Bộ môn Luật Quốc Tế                                        Bộ môn Tư pháp hình sự                        Bộ môn Lý luận - Lịch sử Nhà nước và Pháp luật Phòng Hành chính - Tổng hợp Phòng Quản lý đào tạo và khoa học Trung tâm Nghiên cứu Hỗ trợ pháp lý     Trung tâm Nghiên cứu Luật biển và Hàng hải quốc tế Trung tâm Nghiên cứu Luật so sánh Trung tâm Nghiên cứu Quyền con người và Quyền công dân
4.	Khoa Quản trị Kinh doanh Ban Phát triển chương trình Chương trình đào tạo HSB - MBA Chương trình đào tạo ngắn hạn Chương trình liên kết với Đại học Hawaii Chương trình liên kết với Đại học Irvine Văn phòng
5.	Khoa Quốc tế Bộ môn Khoa học Tự nhiên và Công nghệ Bộ môn Khoa học Xã hội - Nhân văn và Kinh tế Bộ môn Ngoại ngữ Phòng Hành chính - Tổng hợp Phòng Hợp tác và Truyền thông Phòng Quản lý đào tạo và Nghiên cứu khoa học
6.	Khoa Sau đại học Phòng Đào tạo Quốc tế Phòng Hành chính - Tổng hợp Phòng Quản lý đào tạo và khoa học Trung tâm Bồi dưỡng Nguồn đào tạo tiến sĩ Trung tâm Đại học Pháp tại Hà Nội
7.	Khoa Y - Dược Bệnh viện Các bộ môn thuộc khoa Phòng Hành chính - Tổ chức Phòng Quản lý đào tạo và khoa học Trung tâm thuộc khoa
8.	Nhà In ĐHQGHN Phòng Kế hoạch - Hành chính - Tổng hợp Phòng Tài vụ Tổ Máy Tổ Sách
9.	Nhà Xuất bản ĐHQGHN Phòng Biên tập Phòng Hành chính - Tổng hợp Phòng Kinh doanh
10.	Quỹ Khoa học - Công nghệ
11.	Tạp chí Khoa học ĐHQGHN Chuyên san Các khoa học trái đất Chuyên san Khoa học Tự nhiên và Công nghệ Chuyên san Khoa học Xã hội và Nhân văn Chuyên san Kinh tế và Kinh doanh Chuyên san Luật học Chuyên san Ngoại ngữ Chuyên san Toán - Lý Phòng Biên tập
12.	Trung tâm Công nghệ Đào tạo và Hệ thống việc làm Phòng Hành chính - Tổng hợp Phòng Kế hoạch - Tài chính Phòng Quản lý đào tạo và Nghiên cứu khoa học
13.	Trung tâm Đào tạo, Bồi dưỡng Giảng viên Lý luận chính trị Bộ môn Chủ nghĩa xã hội khoa học Bộ môn Kinh tế - Chính trị Bộ môn Lịch sử Đảng Cộng sản Việt Nam Bộ môn Triết học Bộ môn Tư tưởng Hồ Chí Minh Phòng Đào tạo và Nghiên cứu khoa học Phòng Hành chính - Tổng hợp
14.	Trung tâm Giáo dục Quốc phòng – an ninh Khoa Chính trị Khoa Quân sự Phòng Đào tạo Phòng Hành chính - Tổng hợp
15.	Trung tâm Giáo dục Thể chất Thể thao Phòng Đào tạo Phòng Hành chính - Tổ chức
16.	Trung tâm Hỗ trợ Đào tạo và Phát triển đô thị đại học Ban Nhà ở cán bộ Phòng Hành chính - Tổ chức Phòng Quản lý đào tạo và Nghiên cứu khoa học Phòng Quản lý và Phát triển đô thị đại học
17.	Trung tâm Hỗ trợ Nghiên cứu Châu Á
18.	Trung tâm Hỗ trợ Sinh viên Ban Quản lý Ký túc xá Mễ Trì Ban Quản lý Ký túc xá Ngoại ngữ Phòng Hành chính và Công tác HSSV Phòng Tài chính - Kế toán Phòng Tổ chức - Quản trị Trạm Y tế
19.	Trung tâm Nghiên cứu Biển và Đảo Phòng Địa chất Phòng Khoa học xã hội Phòng Kinh tế, Quy hoạch và Phát triển bền vững Phòng Mô hình hóa và Cơ sở dữ liệu Phòng Môi trường và Tai biến Phòng Nghiên cứu Chính sách và Luật Biển Phòng Tài nguyên Văn phòng
20.	Trung tâm Nghiên cứu Đô thị Phòng nghiên cứu Khoa học và Đào tạo Phòng Ứng dụng và dịch vụ Khoa học - Công nghệ Văn phòng
21.	Trung tâm Nghiên cứu Tài nguyên và Môi trường Ban Nghiên cứu rừng ngập mặn Phòng Hành chính - Tổng hợp Phòng Quản lý Khoa học - Công nghệ và Đào tạo
22.	Trung tâm Nghiên cứu về Phụ nữ Phòng Nghiên cứu và Dự án Phòng Tổ chức - Hành chính - Đào tạo
23.	Trung tâm Phát triển Hệ thống Phòng Đào tạo Phòng Hành chính Phòng Kế toán Phòng Kiểm định chất lượng đào tạo
24.	Trung tâm quốc tế Nghiên cứu Biến đổi toàn cầu Phòng Dịch vu Phòng Dự án Phòng Nghiên cứu ứng dụng Văn Phòng
25.	Trung tâm Thông tin - Thư viện Ban Thanh tra Bộ phận Phát triển tài nguyên số Phòng Bổ sung - Trao đổi Phòng Hành chính - Tổng hợp Phòng Máy tính Phòng Phân loại - Biên muc Phòng Phục vụ bạn đọc chung Phòng Phục vụ bạn đọc Mễ Trì Phòng Phục vụ bạn đọc Ngoại ngữ Phòng Phục vụ bạn đọc Thượng Đình Phòng Tài vụ Phòng Thông tin
26.	Trung tâm Truyền thông và Quan hệ công chúng Phòng Hành chính - Tổ chức Phòng Quan hệ công chúng và Tổ chức sự kiện Phòng Truyền thông - Báo chí
27.	Trung tâm ứng dụng Công nghệ Thông tin Phòng Hành chính - Tổng hợp Phòng Nghiên cứu - phát triển Phòng Quản lý dịch vụ Phòng Quản trị mạng và an ninh hệ thống
28.	Trường Đại học Công nghệ Khoa Cơ học kỹ thuật và Tự động hóa Khoa Công nghệ Thông tin Khoa Điện tử - Viễn thông Khoa Vật lý kỹ thuật và Công nghệ Nanô Phòng Đào tạo đại học Phòng Đào tạo sau đại học và nghiên cứu khoa học Phòng Hành chính - Quản trị Phòng Tài vụ - Kế toán Phòng Tổ chức - Hành chính Trung tâm Mạng và E-learning Trung tâm Nghiên cứu Điện tử - Viễn thông
29.	Trường Đại học Giáo dục Khoa Khoa học Giáo dục Khoa Quản lý giáo dục Khoa Sư phạm Phòng Đào tạo và Công tác sinh viên Phòng Kế hoạch - Tài vụ Phòng Nghiên cứu khoa học và Quan hệ Quốc tế Phòng Tổ chức - Hành chính Trung tâm Nghiên cứu và ứng dụng khoa học giáo dục Trung tâm Phát triển Công tác xã hội và Tổ chức cộng đồng Trung tâm Thông tin, tư vấn hướng nghiệp
30.	Trường Đại học Khoa học Tự nhiên Khoa Địa chất Khoa Địa lý Khoa Hóa học Khoa Khí tượng Thủy văn và Hải dương học Khoa Môi trường Khoa Sinh học Khoa Toán - Cơ - Tin học Khoa Vật lý Phòng Chính trị và Công tác sinh viên Phòng Đào tạo Phòng Hành chính – Đối ngoại Phòng Kế hoạch Tài vụ Phòng Khoa học - Công nghệ Phòng Quản trị và Bảo vệ Phòng Sau đại học Phòng Tổ chức Cán bộ Trung tâm Công nghệ Môi trường và Phát triển bền vững Trung tâm Động lực và Môi trường Biển Trung tâm Khoa học Vật liệu Trung tâm Nghiên cứu Địa chất Ứng dụng Trung tâm Nghiên cứu Quan trắc và Mô hình hóa Môi trường Trường THPT chuyên Khoa học Tự nhiên
31.	Trường Đại học Khoa học Xã hội và Nhân văn Ban Thanh tra Bảo tàng Nhân học Bộ môn Khoa học Chính trị Bộ môn Nhân học Khoa Báo chí và Truyền thông Khoa Đông phương học Khoa Du lịch học Khoa Khoa học Quản lý Khoa Lịch sử Khoa Lưu trữ học và Quản trị văn phòng Khoa Ngôn ngữ học Khoa Quốc tế học Khoa Tâm lý học Khoa Thông tin - Thư viện Khoa Triết học Khoa Văn học Khoa Việt Nam học và tiếng Việt Khoa Xã hội học Phòng Chính trị và Công tác sinh viên Phòng Đào tạo Phòng Hành chính - Quản trị Phòng Kế hoạch - Tài vụ Phòng Khoa học và Sau đại học Phòng Quan hệ Quốc tế Phòng Tổ chức Cán bộ Trung tâm Đảm bảo chất lượng giáo dục Trung tâm Hỗ trợ tư vấn tâm lý Trung tâm Nghiên cứu Châu Á - Thái Bình Dương Trung tâm Nghiên cứu Dân số và Công tác xã hội Trung tâm Nghiên cứu Giới và Phát triển Trung tâm Nghiên cứu Tôn giáo đương đại Trung tâm Nghiên cứu Trung Quốc Trung tâm Nghiên cứu và phân tích chính sách Trung tâm Nghiên cứu Văn hoá quốc tế Trung tâm Nghiên cứu, tư vấn phát triển Kinh tế - Xã hội các dân tộc thiểu số Việt Nam Trung tâm Ngoại ngữ và xúc tiến trao đổi giáo dục quốc tế Trung tâm Tiếng Hàn và Nghiên cứu Hàn Quốc
32.	Trường Đại học Kinh tế Ban Thanh tra Bộ phận Khảo thí và Đảm bảo Chất lượng Bộ phận Tạp chí - Website Khoa Kinh tế Chính trị Khoa Kinh tế Phát triển Khoa Kinh tế Quốc tế Khoa Quản trị Kinh doanh Khoa Tài chính Ngân hàng Phòng Đào tạo Phòng Hành chính - Tổng hợp Phòng Kế hoạch - Tài chính Phòng Nghiên cứu Khoa học và Hợp tác Phát triển Phòng Tổ chức Nhân sự Trung tâm Đào tạo và Giáo dục Quốc tế Trung tâm Hỗ trợ Sinh viên Trung tâm Nghiên cứu Kinh tế Phát triển Trung tâm Nghiên cứu Kinh tế và Chính sách
33.	Trường Đại học Ngoại ngữ Bộ môn Ngôn ngữ và Văn hóa Việt Nam Bộ môn Tâm lý - Giáo dục Khoa Ngôn ngữ và Văn hóa các nước nói tiếng Anh Khoa Ngôn ngữ và Văn hóa Nga Khoa Ngôn ngữ và Văn hóa Pháp Khoa Ngôn ngữ và Văn hóa Phương Đông Khoa Ngôn ngữ và Văn hóa Phương Tây Khoa Ngôn ngữ và Văn hóa Trung Quốc Khoa Sau đại học Khoa Sư phạm tiếng Anh Khoa Tại chức Khoa Tiếng Anh Phòng Chính trị và Công tác học sinh, sinh viên Phòng Đào tạo Phòng Quan hệ Quốc tế Phòng Quản lý nghiên cứu khoa học Phòng Quản trị - Bảo vệ Phòng Tài chính - Kế toán Phòng Thiết bị Phòng Tổ chức Cán bộ Phòng Tổng hợp - Hành chính Trung tâm Đào tạo từ xa Trung tâm Multimedia Trung tâm Nghiên cứu giáo dục ngoại ngữ và Kiểm định chất lượng Trường Trung học Phổ thông chuyên Ngoại ngữ
34.	Văn phòng hợp tác ĐHQGHN và Đại học Kyoto
35.	Viện Công nghệ Thông tin Phòng Hành chính - Tổng hợp Phòng Khoa học - Công nghệ và Đào tạo Trung tâm Đào tạo công nghệ mạng Netpro - ITI
36.	Viện Đảm bảo chất lượng Giáo dục Phòng Hành chính - Tổng hợp Phòng Kế hoạch - Tài vụ Phòng Nghiên cứu Đảm bảo chất lượng giáo dục Phòng Nghiên cứu Kiểm tra và Đánh giá giáo dục Phòng Nghiên cứu Quản trị đại học Phòng Quản lý nghiên cứu khoa học và đào tạo Trung tâm Khảo thí và Nghiên cứu xếp hạng cơ sở giáo dục Trung tâm Kiểm định chất lượng giáo dục Trung tâm Phát triển giáo dục quốc tế
37.	Viện Vi sinh vật và Công nghệ Sinh học Phòng Hành chính - Tổng hợp Phòng Đào tạo và Sau đại học Phòng Quản lý thiết bị
38.	Viện Việt Nam học và Khoa học phát triển Phòng Hành chính - Tổng hợp Phòng Đào tạo Phòng Khoa học